Drugsgebruik maakt een einde aan de romance tussen de jonge Louis en Mousse. Hij sterft na een overdosis heroïne, zij blijft zwanger achter. Ze ontvlucht Parijs om in een kleine badplaats haar verlies te verwerken. Laatste deel in François Ozons drieluik over dood en rouw, dat begon met Sous le sable.
Mousse (Isabelle Carré) en Louis (Melvil Poupaud) zijn jong en verliefd. Hun drugsgebruik maakt echter een abrupt einde aan de romance. Als ze per ongeluk een overdosis heroïne nemen, sterft Louis. Mousse ontwaakt uit haar coma en hoort dat ze zwanger is - van Louis. Ze ontvlucht Parijs om in een kleine badplaats Louis’ dood te verwerken. Maanden later staat Louis’ broer Paul voor de deur. Haar zwangerschap maakt ook bij hem emoties los.
Na Sous le sable (2000) en Le temps qui reste (2005) is Le refuge het laatste deel in Ozons trilogie over de dood. Een ander thema is de zwangerschap. De Franse regisseur wilde al jaren een film maken rondom de sensuele metamorfose van een zwangere vrouw. Carré was tijdens de opnames ook werkelijk in verwachting. Het drama werd op het filmfestival van San Sebastian bekroond met de Speciale Juryprijs.